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はじめに:医院経営・開業における“見えない壁”
「クリニックを開業したのに、なぜか利益が思うように出ない」
「税務や経理に不安があるが、誰に相談していいのか分からない」
クリニックを経営・開業しようとする医師にとって、医療の専門知識だけでは越えられない“経営の壁”が存在します。その壁を一緒に乗り越えるパートナーこそが、医療に精通した税理士です。
開業前からの関与が結果を変える:税理士が果たす役割
多くの医師が「開業してから税理士に相談すればいい」と考えがちですが、実は開業準備段階からの関与が非常に重要です。
- 融資審査に通りやすい事業計画の作成支援
- 設備投資・内装工事にかかる税務上の取扱い
- 開業後の資金繰り予測と収支モデルの設計
とくに医療業界では診療報酬や社会保険の仕組みを踏まえた設計が不可欠。医業に不慣れな税理士では、制度のズレを見落とす恐れがあります。
クリニック専門税理士の強み:数字を“読む力”と“業界理解”
「税理士はどこでも同じ」と思われがちですが、医療業界に特化しているかどうかで支援内容には大きな差が出ます。
- 診療報酬の請求サイクルと資金繰りの関係を理解している
- 美容クリニックなど自由診療特有のリスクと税務処理にも対応
- 医療法人化や分院展開のタイミングも長期的視野でアドバイス
また、クラウド会計や電子カルテとの連携支援を行う税理士も増えており、事務効率化にも寄与します。
個人事業主と法人化:税理士が関わるべき重要な転換点
開業直後のクリニックは個人事業主としてスタートするケースが多いですが、一定の利益水準を超えた段階で法人化(医療法人設立)を検討することが一般的です。法人化には以下のようなメリットがあります。
- 所得税・住民税の節税効果(税率構造の違い)
- 退職金の積立や家族への給与支払いが可能になる
- 節税スキームに関するリスクと実効性の判断
ただし、医療法人化には多くの手続きや制約が伴い、税務や社会保険の影響も大きいため、経験豊富な税理士の助言が不可欠です。
医療業界に精通していないと、税務以外の書類作業や特殊なルールに対応できないといったトラブルが起こることもあります。
節税だけではなく、医療業界に明るいか、行政書士との連携など、総合的な視点で税理士を選ぶことが重要です。
顧問料の相場と見落としがちな契約の落とし穴
顧問契約を結ぶ際、顧問料は月額3万〜8万円、決算料は15-25万円ほどが相場と言われますが、業務範囲によって大きく異なります。
- 記帳代行・給与計算・年末調整が含まれるか?
- 開業前の支援費用は別料金か?
- 経営アドバイスはどの程度受けられるか?
このように、「顧問料」の金額よりも、契約内容を丁寧に確認することがトラブルを避けるポイントです。
項目 | 個人クリニック | 医療法人 |
---|---|---|
月額顧問料の目安 | 3万〜5万円 | 5万〜8万円 |
決算・申告料(年間) | 15万〜20万円 | 25万〜30万円 |
含まれる業務内容 | 記帳代行、年末調整、簡易な経営相談 | 給与計算、税務調査対応、経営分析サポート |
対応可能な追加サービス | 開業支援、医療法人化の相談 | 分院展開、役員報酬設計、節税戦略 |
「人として合うか」が、長期的パートナーシップのカギ
医師がよく語るのは、「結局、信頼できるかどうか」「レスポンスが早く、相談しやすいか」が決め手だったという声です。
税理士は数字を扱う専門職であると同時に、経営に迷った時の相談相手です。実際にあった事例では、節税や投資判断、採用戦略にまで相談が及ぶケースも。
長く付き合える税理士は、単なる会計処理の外注先ではなく、経営の“参謀役”として力を発揮します。
都市部でクリニックの税務に強い税理士

対応エリア | 大阪・神戸を拠点に全国対応 |
所在地 | 大阪府大阪市淀川区西中島5-9-5 NLC新大阪ビル |
特徴 | クリニック経営に必要な税務や経理はもちろん、承継や相続、CFO代行まで、トータルでサポート。 事業承継や相続税申告など相続対策コンサルティングに強みを持つ |
出典:クレド税理士事務所公式サイト(https://credo-tax.jp/)
クレド税理士事務所は、クリニック専門の経営コンサルティングを行う株式会社クレドメディカルのグループ企業です。
特に事業承継や相続対策において豊富な実務経験をもとにした的確な支援が強みです。
必要に応じてグループ内の弁護士・社会保険労務士・経営コンサルタントなどの専門家と連携し、ワンストップでの総合的なサポート体制を構築しています。

対応エリア | 全国対応 |
所在地 | 東京都千代田区霞が関3-2-5 霞が関ビルディング33F |
特徴 | 開業後支援、節税対策、増収支援、介護保険対策、医療法人設立、スタッフの人事考課などトータル支援が可能。 医院特有の税務処理を熟知した専門チームが最適な税務処理と財務強化をサポート。 |
出典:日本クレアス税理士法人公式サイト(https://j-creas.com/)
日本クレアス税理士法人は、税理士法人を中心に、社会保険労務士法人、M&A支援法人、財産管理法人、弁護士法人を保有する法人グループです。クリニック経営サポートを全国対応で展開していますが、その中でも大阪本部では医院承継開業支援実績300件以上の実績があり、豊富な経験と専門知識を活かしたサポートが期待できます。

対応エリア | 要相談 |
所在地 | 東京都千代田区丸の内1-8-3 丸の内トラストタワー本館3階 |
特徴 | 医療・介護の経営支援に特化した部署で経営&税務のコンサルティング30年の実績。 開業支援・医療法人設立・節税指導から、離職に関する問題や看護師不足、経営不振のなどのコンサルティングをワンストップで提供。 |
出典:TOMA税理士法人公式サイト(https://toma.co.jp/)
TOMA税理士法人は、東京医師歯科医師共同組合の推奨企業であるMMPG(メディカル・マネジメント・プランニング・グループ)会員です。社会保険労務士法人や行政書士法人とも連携し、医院経営のトータルサポートを得意とします。

対応エリア | 要相談 |
所在地 | 東京都台東区下谷1-6-6 青木会計ビル |
特徴 | 税務申告、医業税務、医業コンサル、医療法人設立、相続対策、資産税タックスプランニング、会計業務、給与計算に対応。 特に「医療・介護分野」及び「資産税対策」を専門とする税理士事務所 |
出典:税理士法人青木会計公式サイト(https://aokikaikei.or.jp/)
税理士法人青木会計では、通常の税務顧問に加え、最近増加している親族内承継や第三者承継などの事業承継や、認定医療法人制度を用いた持分ありから持分なしへ移行する際のサポートにも対応しています。
開業前から開業後も並走してクリニックの先生の良き相談相手となってくれる税理士事務所です。

対応エリア | 首都圏を中心に全国の医療関連の会計をサポート |
所在地 | 東京都品川区大崎5-1-11住友生命五反田ビル10階 |
特徴 | 個人事業主の場合:月額報酬500万円以下:月々25,000円~、確定申告6,000万円以下:130,000円~ 開業医特化で長年の実績あり。医療業界に強い行政書士と複数提携あり。 |
出典:医院・クリニック税理士スマイル公式サイト(https://www.tokyo-smile-clinic.jp/)
医院・クリニック税理士スマイルは開業医特化の税理士事務所として長年の実績を持っています。医療専門のため、税務以外の書類もスムーズに対応してもらえるとのこと。明朗な費用体系で、開業時でも安心してお付き合いができそうです。

対応エリア | 大阪・東京・豊中・南森町に事務所あり |
所在地 | |
特徴 | 約30年にわたる医療機関との実績あり。医療分野特有の税務・会計はもちろん、最適な医業経営分析や情報提供が可能。 医業経営業務・医業経営に精通した経験豊富な専門スタッフがクリニック開業から医業経営、医療法人設立、事業承継、 財産承継までワンストップでサポート。 |
出典:税理士法人FP総合研究所公式サイト(https://www.fp-soken.or.jp/)
税理士法人FP総合研究所は約30年の医療分野の実績を持つ税理士事務所です。税務だけでなく、経営分析や法人設立・承継までワンストップサポートが魅力の税理士事務所です。

対応エリア | 東京・神奈川・埼玉・千葉 |
所在地 | 東京都豊島区駒込3-20-13-202 |
特徴 | 税務顧問 開業支援 経営コンサルティング 事業承継 相続 社外理事・監事 クラウドサービスなどITツールを積極的に活用 |
出典:税理士事務所Crave公式サイト(https://www.iryou-crave.jp/)
税理士事務所Craveはクラウド会計ソフトの会計freeeやチャットサービスなどを積極的に取り入れ、定期訪問以外のやり取りもスピーディ・丁寧に対応してくれる点が魅力の税理士事務所です。医師の副業にも対応しており、現在勤務医の先生の開業相談の対応も可能です。

対応エリア | 東京都・千葉県・神奈川県・埼玉県 |
所在地 | 東京都中央区八丁堀4-12-7 サニービル4C |
特徴 | 新規開業、すでに開業されている開業医の先生の税務相談・税務顧問、会計・税務業務・節税対策サポート等のサービスを提供 現在は勤務医で開業に興味のあるクリニックの先生を対象としたスポット相談サービス |
出典:東京のクリニック・医院専門税理士 川島税理士事務所公式サイト(https://www.kawa-tax.jp/)
川島税理士事務所では、クリニック・医院専門税理士として、税務・会計業務のサポートを提供しています。
こちらも開業に興味のある勤務医~開業前の医師の相談にも対応しています。
※現在こちらのボタンからDLいただける資料は「クレド税理士事務所(クレドメディカルグループ) 」のみとなっています。随時追加予定です。
まとめ:経営を伸ばす“右腕”としての税理士を
クリニック経営において、医師が診療に集中するためには、信頼できる税理士の存在が不可欠です。
税務・会計にとどまらず、資金計画・成長戦略・スタッフ採用までを見据えた「経営パートナー」としての視点で、あなたの医院を支える税理士を選びましょう。
※本記事は、DOCWEBが主催した診療所マネジメントEXPOにおける税理士講演の内容をもとに構成しています。
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クリニック特化税理士のよくある質問(FAQ)
- 開業準備のどのタイミングで税理士に相談すべきですか?
- 開業計画が動き出した初期段階から相談するのが理想的です。資金調達や事業計画の精度に大きく影響するため、融資前から関与してもらうことで、開業後の経営も安定しやすくなります。
- クリニック専門の税理士を選ぶべき理由は?
- 医療業界特有の診療報酬や社会保険制度、医療法人化などに精通しているためです。数字だけでなく、医療経営の流れを理解した上でアドバイスが受けられます。
- 顧問料の相場と選定時の注意点は?
- 月額3万〜8万円が一般的ですが、契約範囲(記帳・給与・年末調整など)によって変動します。費用だけでなく、対応範囲と信頼性を重視しましょう。
- 医療法人化はいつ検討すべきですか?
- 一般的には利益が年間1,000万円を超えた頃が目安とされますが、節税目的だけでなく、社会保険や事務負担も含めて慎重に判断する必要があります。専門税理士のアドバイスがあると安心です。
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