【2026年度比較表】クリニックにおすすめの電子カルテ50選|新規開業医向け医療DX時代の選び方

【2026年6月4日更新】編集部にて製品情報及び補助金情報を最新の内容に更新しました。

この記事の監修者：MICTコンサルティング 大西大輔氏

医療機関へのシステム導入の実績があり、診療所・病院・医療IT企業のコンサルティングおよび講演活動、執筆活動を行う。
2001年　一橋大学大学院MBAコース修了
2001年　医療系コンサルティングファーム「日本経営グループ」入社
2002年　医療IT総合展示場「メディプラザ」設立　（～2016閉館）
2007年　東京、大阪、福岡の3拠点を管理する統括マネージャーに就任
2013年　「電子カルテクラーク養成プログラム」を共同開発
2016年　コンサルタントとして独立し、「MICTコンサルティング」を設立
2018年　MICTコンサルティング株式会社を設立（法人化）
2019年　一般社団法人リンクア（医療介護教育）を設立

はじめに

クリニックの新規開業、その成功には効率的な診療体制の構築が不可欠です。
そして、その鍵を握るのが、クリニックに最適な電子カルテの存在です。
しかし、多様化する電子カルテ市場で、自院に最適なシステムを見つけるのは容易ではありません。クラウド型？オンプレミス型？診療科別の特殊機能は？セキュリティは大丈夫？様々な疑問が浮かぶことと思います。

本記事では、50種類の電子カルテの特徴を徹底比較。システム形式の特徴から診療科別の必要機能まで、開業医が知るべき電子カルテの情報を網羅しています。

さらに、今後の医療DXの動向も踏まえた選び方のポイントをご紹介します。
理想の医院開業へ、最適な電子カルテがその一歩を後押しします。

ぜひ本記事をお読みいただき、自院の理想の姿を思い描きながら、最適な電子カルテを選んでいただければ幸いです。

電子カルテ総論

電子カルテの役割

電子カルテは、レセコンと共に医療機関の基幹システムとして、多くの新しい製品が開発されています。
運用しやすく低コストなクラウド型電子カルテの普及により、現在クリニックでの電子カルテ導入率は約50%にのぼります。（2020年厚労省調べ）
2025年現在、電子カルテは単なる記録システムを超え、受付や予約、会計、各種医療機器やサービスとの連携によりクリニック全体の業務効率化と合理化に貢献する、いまやクリニック経営に必須ともいえるシステムに成長しています。

電子カルテ活用での注意点

クリニックの特徴や先生のスタイルによって求められる機能は様々で、それに合わせて電子カルテの機能も多様化しています。診療科に合った機能はもちろん、どんなクリニックを目指すのか、ご自身の信念や興味といった視点も総合的にとらえることで、これから開業するクリニックの「合理化」に何が必要かを把握できます。
その上で、各電子カルテ製品の特徴を比較していきましょう。

また、特に近年、医療のデジタル化（DX）が急速に進み、オンライン資格確認やマイナンバーカードの活用、電子処方箋などの医療情報のネットワーク化の義務化が推し進められています。さらにAI問診やスマートウォッチの活用など、デジタル技術を活用したサービスも広がりをみせています。

これらのDXの動きを踏まえた機能にも着目し、急速に発展する医療情報の共有化や地域包括システム、将来の全国医療情報プラットフォームに対応可能な機種やメーカーを選択する必要があります。
また、医療DXにおけるクリニック同士の集患競争にも備えて機能を見極めなければなりません。

一方、患者情報の適切な管理と共有における、セキュリティ面での課題にも留意が必要です。
導入する電子カルテのセキュリティ対策はガイドラインに沿っているか、メーカー独自のセキュリティシステムがどのようなものかを調べたうえで選定していくことも重要です。

カルテの選び方は システム形式 ×診療科 ×先生のスタイル

(1)システム形式：クラウド /オンプレミス /ハイブリッドの違い

クラウド型、オンプレミス型、ハイブリッド型の電子カルテにはそれぞれ特徴があります。
各特徴をみてみましょう。

クラウド型電子カルテ

おすすめのクリニック

• 新規開業のクリニック
• IT管理の手間を省きたいクリニック

(2)診療科による違い

診療科ごとに必要とされる機能やニーズが異なるため、診療科に合わせた電子カルテ選定のポイントをおさえておきましょう。

眼科向け電子カルテ

• 眼科特有の検査データ等の管理機能
• 眼科用医療機器との連携
• 保険と自費分野の対応

≪眼科クリニック向け電子カルテ選びのポイント＆製品比較記事へ≫

整形外科向け電子カルテ

• 画像診断機器との連携
• リハビリテーション計画管理
• リハビリカルテの作成

≪整形外科・リハビリクリニック向け電子カルテ選びのポイント＆製品比較記事へ≫

精神科向け電子カルテ

• 長期的な経過記録機能（閲覧性の向上）
• 書類作成（診断書、紹介状、精神科特有の書類）
• 心理検査結果、カウンセリング記録の統合

小児科向け電子カルテ

• 成長曲線管理
• 予防接種スケジュール管理
• 年齢に応じた薬剤量計算機能

≪小児科クリニック向け電子カルテ選びのポイント＆製品比較記事へ≫

訪問診療向け電子カルテ

• 移動に最適化されたモバイル対応UI
• 訪問スケジュール管理
• 在宅向け算定アシスト機能
• 多職種でのコミュニケーション機能

≪訪問診療＆在宅クリニック向け電子カルテ選びのポイント＆製品比較記事へ≫

産婦人科向け電子カルテ

• 妊婦健診記録の体系的管理
• 周産期管理の電子カルテ連携
• 母子手帳の電子化・共有
• 不妊治療補助システム

内科向け電子カルテ

• 複合的な症状管理機能
• 生活習慣病の経過記録・療養計画書の作成
• 処方・検査チェック（病名・薬・検査の相互チェック）

外科向け電子カルテ

• 術式データベースと手術記録管理
• 創傷管理支援機能
• 退院後の経過フォロー機能

内視鏡科向け電子カルテ

• 内視鏡画像の管理・共有機能
• 所見の標準化と経時比較機能
• 検査予約と待ち時間管理

自費診療向け電子カルテ

• 自費価格表の設定と請求管理
• 保険適用外サービスの説明同意管理
• 顧客管理・リピート予約機能

≪美容・自費診療クリニック向け電子カルテ選びのポイント＆製品比較記事へ≫

ここにあげたのは代表例の一部ですが、ご自身の診察内容を具体的にリスト化し、その機能や連携機能が備わった電子カルテを選定することが大切です。

(3)先生のスタイルによる違い

クリニックの開業にあたり、先生方、それぞれが独自のスタイルやポリシーを持っておられることと思います。自身のスタイルに合った電子カルテを選ぶことで、より効率的で満足度の高い診療を実現することが可能で、それこそが患者満足度にも繋がるポイントといえます。

ここでは代表的な診療・経営スタイルと、それに適した電子カルテの特徴を紹介します。

• 待ち時間最小化を重視
  
  予約管理機能が充実し、受付から会計までの一連の流れをスムーズに管理できる電子カルテがおすすめです。WEB予約システムとの連携や、問診情報の事前入力機能の活用でさらに待ち時間を削減できます。
• 患者さんとのコミュニケーションを重視
  
  タブレット対応のUIを持つ電子カルテがおすすめです。診察室で患者さんと一緒に画面を見ながら説明できるため、理解度と満足度の向上につながります。また、患者向けポータルサイトやアプリと連携し、診療情報や検査結果を共有できる機能も有用です。
• データ分析による経営改善を目指したい
  
  豊富な分析機能を持つ電子カルテが適しています。患者属性、診療内容、収益などの多角的な分析が可能で、経営判断に活用できるレポート機能を備えたものを選びましょう。
• 多職種連携を重視
  
  他職種間でのスムーズな情報共有が可能な電子カルテが適しています。看護師や検査技師との連携機能、他院や介護施設とのデータ連携機能などが充実したものを選ぶと良いでしょう。
• 最新の医療技術を積極的に取り入れたい
  
  AI診断支援やオンライン診療機能など、先進的な機能を備えた電子カルテが適しています。常に最新機能が追加されるクラウド型を選ぶのも一案です。

これらのスタイルは一例であり、実際には複数のスタイルを組み合わせた運営を行う場合が多いと考えられます。 ご自身の診療・経営スタイルを明確にし、それに最も適した機能を持つ電子カルテを選びましょう。

クリニック向け電子カルテ比較表

クリニック向け電子カルテクラウド型の基本情報比較表

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クリニック向け電子カルテオンプレミス型の基本情報比較表

≪クリニック向けオンプレミス型電子カルテ比較＆詳細記事へ≫

クリニック向け電子カルテハイブリッド型の基本情報比較表

クリニック向け電子カルテ在宅診療・眼科・産婦人科特化の基本情報比較表

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≪眼科クリニック向け電子カルテ選びのポイント＆製品比較記事へ≫

クリニック向け電子カルテ精神科・耳鼻咽喉科・美容・自由診療特化・有床向けの基本情報比較表

まとめ

本記事では、クリニックの効率化を実現する電子カルテの選び方について、詳細に解説してきました。特に、システム形式、診療科別の特徴、そして今後の医療DXの動向を踏まえた選択の重要性など、多角的な視点から電子カルテ選びのポイントをお伝えしました。
開業を控えた先生方にとって、電子カルテの選択は単なるシステム導入以上の意味を持ちます。それは、診療の質向上、業務効率化、そして患者サービスの充実につながる重要な決断です。
多様化する電子カルテ市場において、自院に最適なシステムを見つけるのは簡単ではありません。しかし、本記事で紹介した比較表や製品一覧、そして選び方のポイントを参考にすることで、より良い選択ができるはずです。
医療のデジタル化が進む今、適切な電子カルテの選択は、開業成功への重要なステップとなります。自院の理想の姿を思い描きながら、最適な電子カルテを選んでいただければ幸いです。

開業準備に奮闘されている先生方のご成功を、心よりお祈りしております。

この記事の監修者：MICTコンサルティング 大西大輔氏

医療機関へのシステム導入の実績があり、診療所・病院・医療IT企業のコンサルティングおよび講演活動、執筆活動を行う。
2001年　一橋大学大学院MBAコース修了
2001年　医療系コンサルティングファーム「日本経営グループ」入社
2002年　医療IT総合展示場「メディプラザ」設立　（～2016閉館）
2007年　東京、大阪、福岡の3拠点を管理する統括マネージャーに就任
2013年　「電子カルテクラーク養成プログラム」を共同開発
2016年　コンサルタントとして独立し、「MICTコンサルティング」を設立
2018年　MICTコンサルティング株式会社を設立（法人化）
2019年　一般社団法人リンクア（医療介護教育）を設立

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この記事の執筆監修者

DOCWEB編集部（一般社団法人 DOC TOKYO）

DOCWEB編集部は、2016年の設立以来、クリニック運営・医療業務・医療ITに関する情報を中心に、複数の医療機関やサービス提供事業者への取材・情報整理を通じて、医療現場と経営の実務に即した情報整理・比較を行っている編集チームです。
公開情報や取材内容をもとに情報を精査し、医師が状況に応じて判断できるよう、比較・検討の材料を提供しています。